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DesignMaster: A Multi-Conditional Diffusion Framework for Rational PROTAC Design
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AI
DOI：10.1093/bioinformatics/btag714.png)
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摘要
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蛋白酶体靶向嵌合体（PROTACs）通过形成与E3泛素连接酶的三元复合物实现靶向蛋白质降解。然而，由于结构-活性关系数据有限以及连接臂构象多样性极大，PROTAC的理性设计仍然极具挑战性。现有的计算方法可分为基于结构的二元复合物建模方法和基于片段的连接臂生成模型。尽管这些方法推动了PROTAC设计的发展，但它们通常在生成过程中忽略了关键的物理化学约束和连接臂长度控制，导致生成的PROTACs缺乏形成具有药物样特性的有效三元复合物所需的平衡结构特性。
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IF:
5.4
论文数:
1.3K
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