任

任兴杰｜Xingjie Ren

a*star - institute of medical biology (imb)

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个人简介

"任兴杰，2017年毕业于清华大学，获得生物学博士学位，主要研究方向为体内基因编辑系统的开发及应用。2017年-2022年在加州大学旧金山分校人类遗传学研究所从事博士后研究，2022年起，担任Associate Specialist，主要研究方向为高通量基因编辑系统的开发，人类疾病相关非编码调控序列和DNA序列变异的功能解析。2025年加盟南京大学现代生物研究院，担任准聘助理教授。 2020年，诺贝尔化学奖被授予Emmanuelle Charpentier和Jennifer A. Doudna以表彰她们开发了CRISPR/Cas9基因编辑系统。在后基因组时代，高效，精确的基因编辑系统极大地促进了人类疾病分子机制的解析，患病风险的预测，精准治疗手段的开发。自从CRISPR/Cas9系统公开发表以来，任兴杰博士在基因编辑与人类疾病领域取得了一系列原创性成果。1）开发了生殖细胞特异性的高效可遗传的体内基因编辑系统，实现多基因同时敲除（PNAS, 2013; Cell Reports，2014）；2）开发了高效体内基因激活系统，实现多基因同时激活（PNAS，2018）；3）构建了高通量CRISPR筛选新策略：CRISPRpath，实现同时鉴定多个靶基因的功能性调控序列（Science Advances，2021）；4）构建了高通量Prime Editing筛选系统，实现在单碱基水平研究基因调控序列和疾病相关遗传变异（Molecular Cell，2023，Cover story）；5）采用高通量CRISPR tilling deletion筛选和基于iPSC的神经细胞诱导分化系统，鉴定到神经系统疾病致病基因的功能性增强子，并发现了一种新型基因调控方式：增强子敲除诱导的转录补偿（bioRxiv, 2024）。迄今，任兴杰博士已经在Science Advances，Molecular Cell，PNAS，Cell Reports，Nature Genetics，Nature Methods等杂志发表学术论文26篇，综述文章4篇。申请Prime Editing相关美国专利一项。"

教育背景

暂无内容

工作经历

暂无内容

荣誉奖项

暂无内容

Systematic assessment of long-read RNA-seq methods for transcript identification and quantification

用于转录本鉴定和定量的长读rna-seq方法的系统评估

NATURE METHODS

IF32.1

2024-06-0715

OAAI

Pardo-Palacios, Francisco J.; Wang, Dingjie; Reese, Fairlie; Diekhans, Mark; Carbonell-Sala, Silvia; Williams, Brian; Loveland, Jane E.; De Maria, Maite; Adams, Matthew S.; Balderrama-Gutierrez, Gabriela; Behera, Amit K.; Gonzalez Martinez, Jose M.; Hunt, Toby; Lagarde, Julien; Liang, Cindy E.; Li, Haoran; Meade, Marcus Jerryd; Moraga Amador, David A.; Prjibelski, Andrey D.; Birol, Inanc; Bostan, Hamed; Brooks, Ashley M.; Celik, Muhammed Hasan; Chen, Ying; Du, Mei R. M.; Felton, Colette; Goeke, Jonathan; Hafezqorani, Saber; Herwig, Ralf; Kawaji, Hideya; Lee, Joseph; Li, Jian-Liang; Lienhard, Matthias; Mikheenko, Alla; Mulligan, Dennis; Nip, Ka Ming; Pertea, Mihaela; Ritchie, Matthew E.; Sim, Andre D.; Tang, Alison D.; Wan, Yuk Kei; Wang, Changqing; Wong, Brandon Y.; Yang, Chen; Barnes, If; Berry, Andrew E.; Capella-Gutierrez, Salvador; Cousineau, Alyssa; Dhillon, Namrita; Fernandez-Gonzalez, Jose M.; Ferrandez-Peral, Luis; Garcia-Reyero, Natalia; Goetz, Stefan; Hernandez-Ferrer, Carles; Kondratova, Liudmyla; Liu, Tianyuan; Martinez-Martin, Alessandra; Menor, Carlos; Mestre-Tomas, Jorge; Mudge, Jonathan M.; Panayotova, Nedka G.; Paniagua, Alejandro; Repchevsky, Dmitry; Ren, Xingjie; Rouchka, Eric; Saint-John, Brandon; Sapena, Enrique; Sheynkman, Leon; Smith, Melissa Laird; Suner, Marie-Marthe; Takahashi, Hazuki; Youngworth, Ingrid A.; Carninci, Piero; Denslow, Nancy D.; Guigo, Roderic; Hunter, Margaret E.; Maehr, Rene; Shen, Yin; Tilgner, Hagen U.; Wold, Barbara J.; Vollmers, Christopher; Frankish, Adam; Au, Kin Fai; Sheynkman, Gloria M.; Mortazavi, Ali; Conesa, Ana; Brooks, Angela N.

Multicenter integrated analysis of noncoding CRISPRi screens

非编码CRISPRi筛选的多中心综合分析

NATURE METHODS

IF32.1

2024-03-1910

OAAI

Yao, David; Tycko, Josh; Oh, Jin Woo; Bounds, Lexi R.; Gosai, Sager J.; Lataniotis, Lazaros; Mackay-Smith, Ava; Doughty, Benjamin R.; Gabdank, Idan; Schmidt, Henri; Guerrero-Altamirano, Tania; Siklenka, Keith; Guo, Katherine; White, Alexander D.; Youngworth, Ingrid; Andreeva, Kalina; Ren, Xingjie; Barrera, Alejandro; Luo, Yunhai; Yardimci, Galip Gurkan; Tewhey, Ryan; Kundaje, Anshul; Greenleaf, William J.; Sabeti, Pardis C.; Leslie, Christina; Pritykin, Yuri; Moore, Jill E.; Beer, Michael A.; Gersbach, Charles A.; Reddy, Timothy E.; Shen, Yin; Engreitz, Jesse M.; Bassik, Michael C.; Reilly, Steven K.

Genetically encoded chemical crosslinking of RNA in vivo

NATURE CHEMISTRY

IF20.2

2022-10-0641