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Computational Methods for Single-Cell RNA Sequencing
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DOI：10.1146/annurev-biodatasci-012220-100601.png)
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摘要
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单细胞RNA测序 (scrna-seq) 提供了跨物种和疾病的数百万个细胞的高维目录。这些数据刺激了数百种计算工具的发展，以获得新的生物学见解。在这里，我们概述了scrna-seq分析管道的组成部分以及这些步骤的计算方法。我们描述了可用的方法，重点介绍了执行良好的基准研究，并确定了其他基准研究和计算方法的机会。随着单细胞组学的生化方法的发展，我们建议结合开发强大的分析管道，以应对新数据提出的挑战，并有原则地选择适合解决生物学问题的分析方法。
Keyword:
computational methods
single-cell RNA sequencing
data integration
gene regulatory networks
dimensionality reduction
clustering
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